iTRAQ定量蛋白质组学
- 公司名称 武汉傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型号
- 产地
- 厂商性质 经销商
- 更新时间 2024/3/11 11:07:52
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实验介绍
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,进行LC-MS/MS分析,可同时比较多种不同样本中蛋白质的相对表达含量
实验流程
*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析,对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断。
应用方向
生物领域各个研究方面,如:
? 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等
? 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等
? 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等
? 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等
? 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等
? 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等
? 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等
? 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等
数据分析
标准数据分析内容 | |
蛋白质总鉴定数量分析 | 蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 | 亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
质量控制分析 | 肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析内容 | |
WGCNA共表达分析 | 获得与表型强关联的核心蛋白质 |
趋势聚类分析 | 探讨蛋白质的表达趋势模式 |
技术优势
? 具有2-8 plex标签,可同时标记2-8组样本进行表达差异分析
? 是一种体外标记技术,可标记动物、植物、微生物、临床、体液或细胞等多种样本
? 不同标签混合后上机,具有较好的平行性,避免技术误差,提高检测效率
? 与凝胶方法相比,iTRAQ可发现膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、强碱和强酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白质,对低丰度蛋白质亦有较好的检出率