關鍵的控制部分有三個：
1.溫度探頭
2.是制冷壓縮機
3.熱風機有的用紅外線加熱，或是直接用電阻絲加熱
恒溫箱溫度探頭的測量端伸在恒溫箱內部的空氣中，不能與物體或是箱避接觸，實時監測箱內的溫度，在控制面板上，可以設置恒溫箱的恒溫范圍，即設置允許的溫度上限和下限，當探頭檢測到溫度低于下*，開啟熱風機加熱，溫度開始回升，當探頭檢測到溫度高于上*，開啟制冷壓縮機制冷，溫度下降，如此來回控制。
有的恒溫比較高級，可以設置偏離度，比如說正常情況下，溫度應是達到下*開始加熱，此時加熱稍晚，因為在加熱開始后，溫度可能還要下降一段時間，這時可以設置偏離度，使之提前加熱或制冷
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