ThruPLEX DNA測序文庫制備試劑基于ThruPLEX化學技術制備DNA文庫，文庫的多重測序能力提高，具有更高多樣性。試劑zui高包含96個illumina兼容索引（indexes）。ThruPLEX DNA測序文庫制備試劑可用于DNA/RNA 測序和ChIP測序，并與主流目標區域富集平臺兼容。

ThruPLEX DNA-seq應用

全基因組測序（WGS）

全外顯子組測序（WES）

靶向測序

染色質免疫共沉淀測序（ChIP-seq）

RNA-seq

應用特別介紹：ChIP-seq

ChIP-seq引用文獻：2016至今有11篇ThruPLEX用于ChIP-seq 的高影響因子文章發表。

簡單的工作流程：3個反應步驟在一個管內進行，只需2h，手動操作15min

模板修復—末端連接—擴增

組份：

分模板準備、文庫合成和文庫擴增三大部分。保存-20℃。

模板準備緩沖液+模板準備酶（紅色）

文庫合成緩沖液+文庫合成酶（黃色）

文庫擴增緩沖液+文庫擴增酶（綠色）

Illumina索引（indexing）試劑（藍色）

無核酸酶水（無色）

ThruPLEX DNA-seq特點

高靈敏度、高性能：以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料，尤其適合ChIP-DNA

快速簡便的工作流程：單管或單孔3步操作，2小時，無需轉移操作

可重復的結果：構建文庫具有高多樣性、低重復度和GC偏差

完整的文庫構建試劑：優化的illumina index引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無核酸酶水

兼容主流目標區域富集平臺：Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes

ThruPLEX技術—莖環形接頭

莖環形接頭的特別設計，能夠有效抑制二聚體的形成，免去了大多數Illumina等文庫制備技術需要的中間純化和樣品轉移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應管、2個小時、3步反應的簡單過程。僅在PCR反應后進行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對珍貴樣品進行有效分析。

莖環形接頭的設計降低實驗背景，免去了中間純化步驟。

ThruPLEX DNA-seq 制備文庫高多樣性低重復度低GC偏差

ThruPLEX DNA-seq Kit 優于其他NGS文庫制備試劑。與其他試劑相比，ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA，構建多樣性更好（左圖），重復更少（右圖）的文庫（25 M read pairs）。NGS文庫分別采用圖示對照gDNA起始量，以相應的文庫制備試劑制備，采用MiSeq v3 flow cell測序。

ThruPLEX DNA-seq Kit 減少了GC偏差。以人類基因組相對覆蓋度為GC含量（%）的函數（50 ng DNA起始）。（左圖）ThruPLEX DNA-seq Kit 在整個范圍內都有出色的覆蓋。（右圖）ThruPLEX DNA-seq Kit （金色）與參試的其他試劑一樣好或更好。請注意，在這些圖中的覆蓋度應該為1。人類基因組中的GC含量分布以紅色柱形圖表示。

自備試劑：

Agencourt®XP 核酸純化磁珠（Beckman Coulter，目錄號A63880）

引用文獻：

2017年以來，谷歌學術上搜索Rubicon ThruPLEX DNA-seq 有94篇文獻。

背景介紹

新一代測序（英文名稱Next Generation Sequencing，縮寫NGS）是一個需求快速發展的動態領域。無論樣品類型或應用如何，每個樣品都需要制備DNA文庫，以便在Illumina NGS平臺上進行測序。

文庫制備過程（下圖）涉及將Illumina測序接頭與片段DNA連接并添加Illumina兼容索引（indexes）以允許多個樣本的流動池混合測序（多重平行測序）。文庫制備是NGS操作流程的關鍵步驟，并直接影響測序結果的質量。

隨著NGS臨床應用的出現以及隨著NGS測序儀器功能的日益強大，研究人員和臨床醫師正在越來越多地調查更加困難和具有挑戰性的樣品，這些樣品數量有限，使用量少，有的還受損。在許多應用中，例如來自血漿的游離DNA，樣品DNA材料有限且高度降解。

在DNA樣本比較珍貴時，例如腫瘤組織的分析，使用少量樣本的能力可以盡可能多的保存樣本用于多種用途。臨床樣品還需要仔細追蹤樣品，樣品從不離開試管的方案有利于確保準確的樣品追蹤并避免污染。這種不斷增長的趨勢需要文庫制備試劑盒，它能夠以簡單的工作流程精確地保留樣本的復雜性并提供更高的靈敏度和更高的多重測序能力。

滿足這些需求是ThruPLEX DNA測序試劑的核心。它的開發旨在提高多重測序能力，并從少量樣本制備高品質、兼容Illumina的NGS文庫。ThruPLEX DNA-seq的三步式單管文庫制備是業界zui簡單的操作流程，可zui大限度地減少處理錯誤和寶貴樣品的損失。

名詞解釋：ChIP-seq 結合DNA測序分析蛋白與DNA的相互作用，確定DNA相關蛋白的結合位點。

ChIP：染色質免疫共沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱結合位點分析法。

ChIP測序也稱為ChIP-seq，是一種用于分析蛋白質與DNA相互作用的方法。 ChIP-seq將染色質免疫沉淀（ChIP）與大規模平行DNA測序相結合，以確定DNA相關蛋白的結合位點。它可以用來精確地定位任何目標蛋白質的結合位點。

ThruPLEX DNA-seq訂購信息

R400407/RB4407為期貨

品牌	貨號	名稱	規格	舊貨號
Rubicon	R400407	ThruPLEX DNA-seq 96D Kit	96 次	RB4407
其他規格
Rubicon	R400406	ThruPLEX DNA-seq 48D Kit	48 次	RB4406
Rubicon	R400427	ThruPLEX DNA-seq 48S Kit	48 次	RB4427
Rubicon	R400428	ThruPLEX DNA-seq 12S(48) Kit	48 次	RB4428
Rubicon	R400523	ThruPLEX DNA-seq 6S(12) Kit	12 次	RB4523