大多數的玻璃瓶可以在-4℃的溫度下保持完好無損。在常溫下，短期儲存試驗樣品不需要任何的特殊預防措施，可以儲存在溫度低至-80℃的含有有機溶劑的玻璃瓶中。但是，要特別使用由聚丙烯制成的瓶蓋。因為這些材料在溫度低于0℃的情況下，會變得越來越脆。以下是玻璃瓶冷凍所要遵循的一些原則：
儲存瓶
把它當做儲存瓶時，最重要的是避免陽光的直射。最好在儲存和解凍的過程中，把它放在塑料瓶架上。
許多液體在解凍的過程中，尤其是樣品中含大量水時，它會對密閉的容器施加相當大的壓力，還可能導致其破裂。因此，在低溫下儲存液體樣品時，樣品不能裝滿整個容器。
在極低的溫度下，卡口瓶是不建議使用的，在低溫下使用的玻璃瓶應該有較大的內部容積和較小的開口。如8-425螺紋瓶和透明鉗口樣品瓶。應該使用具有良好效果的大開口瓶。但必須遵守操作注意事項，使用一個封閉的頂蓋或粘結隔膜打開頂蓋。
當玻璃瓶在低溫下存放較長時間，建議壓接密封或頂固螺旋瓶蓋。
解凍冷凍瓶
冰凍的瓶子必須格外小心。在一般情況下，玻璃瓶暴露在溫度急劇變化的環境中時，玻璃瓶會開裂（特別是棕色瓶子）。所以請勿將冷瓶放在溫暖的地方，還要避免撞擊。把瓶子放在金屬物體上面，也會增加它的破損可能性。
要注意的是瓶子的溫度會逐漸接近外部環境的溫度。此外，在瓶內溫度沒有和外部溫度一樣時，最好不要去觸碰或撞擊它。
溫補冷凍瓶
玻璃瓶應讓它逐漸回暖，溫熱玻璃瓶應避免溫度的急劇變化。不建議使用水浴、熱水箱、烤箱或其他高溫熱源去暖玻璃瓶。在室溫緩慢的通過熱傳導去解凍玻璃瓶是合理的。溫度低于-20℃的玻璃瓶應先放在-4℃至0℃的冰箱內。這樣能減小玻璃瓶損壞的可能性。
PTFE/硅橡膠隔墊
用于阻隔溫度低于-40℃的物品。在溫度下降到-80℃時，PTFE/硅橡膠隔墊仍保持很好的密封性，但必須注意的是，不要過分擰緊瓶蓋。應當在隔墊勿明顯變形的情況下，擰緊瓶蓋。請注意，我們發布PTFE/硅橡膠隔墊的溫度范圍是-40℃以上。這個范圍是指水凝固不破壞瓶子情況下的溫度。
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