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由于實驗室超純水機使用方便、效率高，在市場上已經有了較廣泛的運用。但很多用戶在選擇實驗室超純水機時往往無從下手，一般從以下三方面考慮：
一、用水量
目前市場上的超純水機的造水量一般在5-20升/小時，20升以上的就是非標準機型。客戶應根據實際用水量來選用超純水機的規格，一般遵循2倍關系原則。如用水量是20升/天，則選用規格為10升/小時的機器，如果選用規格太小，超純水機的耗材消耗會很快，選用規格太大，則形成浪費。如果集中用水量大，則需要選購較大的純水桶，否則造水跟不上。
二、用水水質
國家實驗室標準用水有一級水、二級水、三級水三種水質，但大多數實驗室用兩種水質即可，一是三級水，如蒸餾水，用于玻璃器皿的清洗等；二是一級水，主要用于化學分析或者液相、原子吸收等精密儀器分析。以自來水為水源的超純水機都具有兩個（兩種水質）的出水口，一是純水，即三級水；二是一級水，即超純水（嚴格意義上講一級水的電阻大于10兆歐，而超純水的電阻大于18兆歐）。客戶應根據實際水質需求來選用超純水機的檔次。
三、原水水質
客戶在選購超純水機時一定要向廠商提供原水的水質狀況，比如泥沙多，硬度高，地下水等情況，超純水機的工藝是根據原水水質的好壞來確定的，泥沙多，要添加預處理裝置，硬度高，要添加軟化裝置，含鹽量高，要采用二級反滲透工藝等。如果選用以純水為水源的超純水機，則只需要提供水質需求和用水量就可以了。
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