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針頭式過濾器性能好、減少了系統停機時間、延長色譜柱壽命、提高了樣品的完整性；機械強度高，耐大多數有機溶劑，非常適合堿性溶液。
針頭式過濾器的選購指南：
1、化學溶劑耐受性
過濾器是否需要具備對于酸、堿或有機溶劑的耐受能力？根據應用選擇樣品制備針頭式過濾器或流動相濾片過濾器時，必須著重考慮其化學相容性。以下寬泛的選擇原則，僅用于基本參考，請參閱《針頭式過濾器化學兼容性表》，以確定具體應用的過濾器類型。
2、水相樣品
過濾水相樣品時，親水性濾膜由于其水親和性而備受青睞，可利用配備GHP(親水性聚丙烯)、PES (聚醚砜)、尼龍或PVDF(聚偏氟乙烯)濾膜的過濾器。
3、氣體與侵蝕性有機溶劑
疏水性濾膜排斥水分，對侵蝕性有機溶劑具有惰性，從而成為氣體與有機溶劑處理時的可選擇配備PTFE(疏水性聚四氟乙烯)濾膜的過濾器。
4、含水溶液與有機溶劑溶液
不同聚合體的濾膜有著不同的化學相容性。基于應用和化學相容性，可能存在一種或多種濾膜與針式過濾器組合的可能性。通常，由于疏水性/親水性以及化學相容性的限制，單一類型的過濾器不可能勝任所有的應用。
5、極低的萃取水平
過濾器用于去除不需要的微粒物，以提高度。然而，選用不恰當的過濾器，可能使之成為污染物的來源，可萃取物被從過濾器裝置上洗脫，并進入樣品。這些不需要的假象將會危及分析結果的準確性，可萃取物造成的一些問題包括：共同洗脫、定量錯誤以及外來峰值。
6、樣品吸附
應選擇低吸附性的過濾器，譬如配備GHP濾膜的針頭式過濾器；GHP濾膜的生物分子結合能力非常之低，典型的結合水平遠遠低于1%。
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