浮游細菌采樣器是一種的多孔吸入式塵菌采樣器。其原理是，根據顆粒撞擊原理和等速采樣理論設計，采樣直接，采樣口風速與潔凈室內風速基本一致，能更準確地反映潔凈室內的微生物濃度。采樣時，帶塵菌空氣高速通過微孔，被撞擊在培養皿內的瓊脂表面；這些活體微生物在培養過程中，發生動態再水化過程，高速生長，從而更快得出結果。

在選擇浮游細菌采樣器時建議考慮以下幾點：

1、采樣流量。
采樣流量的大小直接決定了檢測定量單位體積空氣浮游菌的速度，流量大，采集快，流量小，采集就慢。

2、撞擊速度
大家都知道浮游菌采樣器大部分都是基于安德森撞擊原理，撞擊速度側面影響浮游菌的捕獲率。

3、材質
外殼的材質決定能否耐受的各種清潔和消毒方式。研究表明，不銹鋼外殼最便于清潔和消毒，而且可耐受多種清潔和消毒方式。

4、操作方便與否
目前浮游菌采樣器檢測環境大部分都處在無菌室內，在無菌室需要穿防護服，帶塑膠手套，目前由于觸摸屏的廣泛普及，大部分浮游菌采樣器操作都在觸摸主控屏幕上進行操作，而有的浮游菌采樣器廠家配置的觸摸屏檔次有限，根本不方便帶塑膠手套操作，所以這些物理特性希望大家也能引起重視。

5、生物采樣效率和物理采樣效率