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Phusion 熱啟動II高保真DNA聚合酶是DNA聚合酶和一個具可逆結合性能的，特異的Affibody蛋白的融合體，Affibody蛋白在常溫下可抑制DNA聚合酶的活性，從而可有效阻止該酶非特異性的擴增。此外，Affibody配基可抑制該酶3’→5’外切酶的活性，因此阻止了建立反應體系時對引物和模板DNA的降解。在聚合溫度，Affibody分子被釋放，聚合酶充分活化。在PCR實驗過程中，Phusion熱啟動II高保真DNA聚合酶不需要額外的激活步驟。