詳細(xì)介紹
SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測(cè)試劑盒
本產(chǎn)品是一步法RT-qPCR檢測(cè)新-型-冠-狀-病毒(SARS-CoV-2)Omicron毒株(B.1.1.529)中N區(qū)存在的特征性突變del31-33的試劑盒。del31-33 是指N區(qū)第31~33位中E、R 和 S三個(gè)氨基酸缺失的突變。Omicron毒株是在南非shǒu次發(fā)現(xiàn)的變異株,在刺突蛋白中含有30多個(gè)突變。它比傳統(tǒng)的變異株具有更高的傳染性,因而被世界衛(wèi)生組織(WHO)列為“關(guān)切變異株"(Variant of Concern;VOC)。
本產(chǎn)品針對(duì)的是突變位點(diǎn)少的N區(qū)突變,并非突變位點(diǎn)多的S區(qū)。因此引物探針不會(huì)與其他突變位點(diǎn)產(chǎn)生反應(yīng)、干擾測(cè)試,即可特異性、高靈敏度檢測(cè)Omicron。
經(jīng)證實(shí),本產(chǎn)品不與Alpha變異株、Beta變異株、Gamma變異株產(chǎn)生反應(yīng),只與Omicron毒株產(chǎn)生特異性反應(yīng)。
SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測(cè)試劑盒【281-37703】
◆試劑盒組成
20 Reactions | |
RT 酶混合物(20×) | 20 μL×1 |
一步反應(yīng)混合物(2×) | 200 μL×1 |
野生型引物&探針混合物(Wild Type Primer & Probe Mixture) | 10 μL×1 |
N del31-33突變型引物&探針混合物(N del31-33 Mutant Type Primer & Probe Mixture) | 10 μL×1 |
◆特點(diǎn)
● 容易判斷
● 使用突變型和傳統(tǒng)型的引物/探針套裝時(shí),可通過比較Ct值進(jìn)行判斷
● 一步法RT-qPCR法快速檢測(cè)突變
● 約70 min 即可完成
● 使用獨(dú)立研發(fā)的引物探針進(jìn)行高靈敏突變檢測(cè)
● 當(dāng)與其他突變體檢測(cè)試劑盒組合使用時(shí),所有變異株均可于同一反應(yīng)條件下在1塊96孔板上進(jìn)行檢測(cè)
● N501Y、E484K、L452R、E484Q、del247-253、N del31-33試劑盒的所有PCR反應(yīng)條件相同,因此可在
● 1塊96孔板上進(jìn)行檢測(cè)
◆檢測(cè)原理
采用TaqMan® 探針的1-step RT-qPCR。
▼使用前 在病毒RNA量多的情況下,使用傳統(tǒng)(非突變)型檢測(cè)用的Wild Type Primer / Probe,也能在變異株中觀察到擴(kuò)增信號(hào)。 請(qǐng)務(wù)必使用傳統(tǒng)(非突變)型檢測(cè)用的Wild Type Primer/Probe 和突變型檢測(cè)用的Mutant Type Primer/Probe兩種進(jìn)行檢測(cè)。比較兩種Ct值,若突變型檢測(cè)用Mutant Type Primer/Probe的Ct值較小,則判斷該病毒為變異株。 |
◆實(shí)驗(yàn)案例
變異株檢測(cè)的應(yīng)用數(shù)據(jù)
用以下5種新-型-冠-狀-毒株的純化RNA對(duì)本試劑盒進(jìn)行測(cè)試:
● Omicron毒株(B.1.1.529):TY38-873P1,由日本國立傳染病研究所提供
● alpha毒株(B.1.1.7):QHN001,N501Y突變,由日本國立傳染病研究所提供
● Beta毒株(B.1.351):TY8-612,N501Y突變,E484K突變,由日本國立傳染病研究所提供
● gamma毒株(P.1):TY7-501,N501Y突變,E484K突變,由日本國立傳染病研究所提供
● 傳統(tǒng)毒株(VR-1986HK):從ATCC購買的熱滅活新-型-冠-狀-病毒株
樣本拷貝數(shù):5000拷貝/孔
循環(huán)數(shù):45
① Omicron株(B.1.1.529):TY38-873P1
Omicron毒株在N區(qū)含有del31-33突變,因此N del31-33 Mutant type Primer / Prob的擴(kuò)增曲線(紅色)比Wild type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(藍(lán)色)更早起峰。
② alpha株(B.1.1.7):QHN001
alpha毒株在N區(qū)中不含del31-33突變,因此Wild type Primer / Probe(藍(lán)色)的擴(kuò)增曲線比 N del31-33 Mutant type Primer / Probe(紅色)的擴(kuò)增曲線更早起峰。雖然alpha毒株與Omicron毒株均含有N501Y突變,但經(jīng)確認(rèn)本產(chǎn)品不與alpha毒株產(chǎn)生反應(yīng)。
③ Beta株(B.1.351):TY8-612
Beta毒株在N區(qū)中不含有del31-33突變,因此Wild type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(藍(lán)色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(紅色)更早起峰。雖然Beta毒株與Omicron毒株均含有N501Y突變,但經(jīng)確認(rèn)本產(chǎn)品不與Beta毒株產(chǎn)生反應(yīng)。
④ gamma毒株(P.1):TY7-501
gamma毒株在N區(qū)中不含del31-33,因此Wild type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(藍(lán)色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線更早起峰。雖然gamma毒株與Omicron毒株均有N501Y突變,但經(jīng)確認(rèn)本產(chǎn)品不與gamma毒株產(chǎn)生反應(yīng)。
⑤ 傳統(tǒng)毒株(VR-1986HK):從ATCC購買的熱滅活新-型-冠-狀-病毒株
傳統(tǒng)毒株在N區(qū)中不含del31-33突變,因此Wild type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(藍(lán)色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(紅色)更早起峰。
對(duì)照RNA的檢測(cè)數(shù)據(jù)
使用本試劑盒測(cè)定合成Omicron菌株的對(duì)照ssRNA。
在不含N del31-33突變的對(duì)照ssRNA(Wild Type Control RNA)中,Wild type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(藍(lán)色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(紅色)更早起峰。
在含N del31-33突變的對(duì)照ssRNA(N del31-33 Mutant Type Control RNA)中,N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(紅色)比Wild type Primer / Probe的擴(kuò)增曲線(藍(lán)色)更早起峰。
PCR反應(yīng)條件
將板置于qPCR儀板,按以下流程設(shè)定。
◆變異株一覽表
變異株 | N501Y突變 | E484K突變 | L452R突變 | E484Q突變 | del247-253 突變 | N del31-33 突變 |
傳統(tǒng)毒株 | - | - | - | - | - | - |
Alpha毒株 (B.1.1.7) | + | - | - | - | - | - |
Beta毒株 (B.1.351) | + | + | - | - | - | - |
Gamma毒株 (P.1) | + | + | - | - | - | - |
Epsilon毒株(B.1.427/B.1.429) | - | - | + | - | - | - |
Kappa毒株(B.1.617.1) | - | - | + | + | - | - |
Delta毒株 (B.1.617.2) | - | - | + | - | - | - |
Lambda毒株 (C.37) | - | - | - | - | + | - |
Omicron毒株(B.1.1.529) | + | -※ | - | -※ | - | + |
※含E484A突變
產(chǎn)品編號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 |
281-37703 | SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測(cè)試劑盒 | 20 Reactions |
※ 本頁面產(chǎn)品僅供研究用,研究以外不可使用。
SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測(cè)試劑盒