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賽默飛世爾科技(中國)有...

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新品速遞!基于NGS的甲基化檢測方案,助力腫瘤標志物的開發(fā)

閱讀:14      發(fā)布時間:2024-11-20
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表觀遺傳學(xué)(Epigenetics)是研究基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因表達的可遺傳變化的一門學(xué)科。DNA甲基化是哺乳動物基因組中發(fā)生的表觀遺傳事件之一。DNA分子(胞嘧啶)的甲基化會影響基因表達。研究表明,DNA甲基化模式和臨床表型之間有著非常緊密的聯(lián)系,可以用作疾病診斷和指導(dǎo)治療的生物標志物,甲基化失衡與腫瘤進程關(guān)系密切。
 

賽默飛重磅推出Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測方案

為此,賽默飛推出用于癌癥研究的Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測方案,用于研究gDNA或FFPE 樣本gDNA特定基因的甲基化水平。

這一檢測方案所選擇的檢測靶點由BLUEPRINT聯(lián)盟所建議。BLUEPRINT聯(lián)盟基于多平臺多方法學(xué)開展一項大規(guī)模的研究項目,深入分析健康人和患者的基因激活或抑制差異,從而驗證出癌癥生物標志物。因此,這一檢測方案是您靶向研究癌組織DNA甲基化水平的可靠方案。

? 檢測用途:包含40個擴增子(內(nèi)含2個對照),用于檢測38個靶標的甲基化水平,這些靶點涵蓋Bock文獻中所涉及的與結(jié)腸癌,前列腺癌,白血病和淋巴瘤等癌種腫瘤標志物相關(guān)的靶標。(Bock, C. et al. Nature Biotechnology 34, 726–737 (2016))

? 優(yōu)勢:支持FFPE樣本,低樣本起始量(10 ng)即可檢測DNA甲基化情況,靈敏度高,并配套數(shù)據(jù)解讀方案

? 樣品起始量:10-100 ng/樣本

? 通量:16 samples/530 chip

? 數(shù)據(jù)解讀:配套甲基化分析插件Methylation Analysis Plugin,用于分析每個擴增子甲基化和未甲基化的Reads數(shù)

? 適用范圍:適用于腫瘤標志物的開發(fā)和研究,可用于腫瘤患者的樣本,從而尋找腫瘤相關(guān)的特異性甲基化生物標志物

客戶體驗

David Berman, MD, PhD

加拿大皇后大學(xué)(Queen’s University)

癌癥研究中心主任

 

· Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測法能幫助您解決哪些實驗問題?

我們的實驗室開發(fā)用于臨床癌癥診斷和管理的生物標記物。通過芯片法以及甲基化特異性PCR(MSP),我們已經(jīng)在前列腺癌中鑒定了許多有利于診斷和預(yù)后DNA甲基化位點。我們發(fā)現(xiàn)它們單獨都無法提供精確的診斷或臨床信息,但結(jié)合起來,它們具有很大的應(yīng)用前景。同時, MSP很難進行多位點檢測,同時非常耗費人力。生物芯片法需要相對大量的輸入DNA。因此,以上方法的限制使我們的研究會遺漏特別感興趣的位點。重要的是,這些方法提供平均甲基化水平,這意味著在癌癥中,良性細胞可以掩蓋癌細胞特異性的異常甲基化。

· 為什么您選擇Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測方案而不是其他方案?

AmpliSeq甲基化測序靈敏度高、準確度高,僅需10 ng的樣本就能檢測幾十個靶點。除了能夠?qū)崿F(xiàn)多靶點檢測和性能穩(wěn)定外,賽默飛還開發(fā)了專屬數(shù)據(jù)分析平臺。這些都是我們選擇這一產(chǎn)品的原因。

· Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測法和您以前用的方法相比如何?

該方法操作簡單,并提升了報告流程、準確性、特異性、靈敏度和穩(wěn)定性等方面的性能。

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? 登入—Made to Order panels—Pre-designed by our community—搜索“Methylation"

? 或通過此鏈接訂購:

/panels/search.action?q=methylation&searchFacetValues=%22Panel+Type%22%2C%22COMMUNITY_PANEL%22&offset=0&pageLength=30&sortCriterion.fieldName=&sortCriterion.descFlag=

* 僅供研究使用,不用于診斷過程

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